虚拟显微镜是美国航天局资助的项目，提供模拟美国宇航局虚拟实验室“计划的一部分全世界的学生和研究人员的科学仪器。 本网站作为家为基地成像技术集团的贡献，项目，即虚拟显微镜和多维的，高清晰度图像数据集他们认为。 目前，我们提供了总额超过62 gigapixels图像数据的90个样品。 虚拟显微镜， 这是可以免费下载支持电子，光，扫描探针显微镜的功能，这些仪器的数据集，培训材料，以了解显微镜，以及其他相关的工具。 该项目是开源的代码是可用Sourceforge的。
虚拟仪器 
目前我们的虚拟仪器代码支持数据：从三个不同的乐器在我们的显微镜套件了飞利浦环境扫描电子显微镜(ESEM ) ，荧光显微镜，原子力显微镜。  5倍放大的微距镜头，我们也适应了一个高分辨率的数码单反相机捕捉到一些标本，以及包括一些艺术渲染显微镜数据。
虚拟显微镜的目的是为探索这些前拍摄的图像数据，因为如果他们使用真实的乐器，在实时方法与目前用户。 为了实现这一目标，虚拟显微镜提供的能力，加载/卸载标本，导航到该标本上的任何一点，改变放大倍率，调整图像参数(对比度和亮度)，改变重点，分析元素组成，测量功能，并呈现在三维空间中的数据。 此外，该接口允许专家和外行人都注释标本和/或载入先前创建的注释。 
除了用户界面，我们已经写了一套定制软件收集和处理的图像数据所涉及的各项任务的后端。 这包括自动化数据收集成千上万的图像来形容一个单一的标本，并拼接和混合这些平铺图像数据集的例程。